《怪物弹珠第2季》接续第一季的剧情，与握有钥匙的水泽葵，影月明，若叶皆实一起，如今的莲正迈出通往谜团的一步。主人公·焰莲回到曾经住过的街道·神之原，感受到了违和感。他确实应该在这条街道住过，却对那时的事情没有记忆。此时，莲的智能手机突然被安装了从没见过的游戏，其名为《怪物弹珠》。他带着从手机中飞向现实世界的怪物，在街道中展开了战斗！经过战斗，莲注意到了在自己体内沉睡的谜之记忆的正体，以及，怪物弹珠究竟是何物。与握有钥匙的水泽葵、影月明、若叶皆实一起，如今的莲正迈出通往谜团的一步，对于前方沉睡着无法想象的真相一事，仍然一无所知。。秦素素只觉得一颗心不断的颤动，这一连串的‘讨厌’和‘不准’，又是什么意思？她几乎忍不住想要问清楚。可是，一丝丝理智将她拽住。那份答案，她不见得能承受得起。重喘口气，她呢喃出声：“你疯了……慕靖宇，你肯……