《魔法少女奈叶StrikerS》是《魔法少女奈叶》系列第三部TV动画。动画于由Seven Arcs负责制作，于2007年4月1日开始播放，全26集已播放完毕。动画以前作十年后为背景描写，不仅带来了前作主人公成年之后的身心上的改变，同时也大幅扩大魔法知识范围和角色数量。而且还添加了政治、军事、科技、心理战等为题材的深沉元素，更加注重于对朋友和同伴之间的关爱描写、延续了前作的信念，带给观众完全不同风格的魔法少女系列作品。“闇之书事件”（参照魔法少女奈叶A's）的10年后。踏入19岁的高町奈叶、菲特·T·哈洛温、八神疾风三人，怀抱着彼此的友情牵绊、为了追求各自的梦想实现而加入时空管理局，并以一流魔导师的身分活跃。在此当中，出现了新发现的太古遗产“圣遗晶石”（レリック），以及以此为目标而出现的谜样机械兵器“共鸣拓发者”（ガジェットドローン）。为了迅速对应日后被称为“圣遗晶石事件”的状况，八神疾风考虑到设置能够迅速对应的独立部队的必要性，设立了专责处理与太古遗产关连任务的特殊部队——“机动六课”。另一边，时间回溯到四年前。昴·中岛在遭到机场火灾卷入而几乎丧命之际，由于奈叶的出现而得救。因为憧憬著如同“自己理想中的形象”一般的奈叶，昴在当晚的满天星空之下，做出了“成为管理局的魔导师”的决定。四年后，经过一番波折而顺利成为管理局的新进魔导师的昴，与训练校时代的伙伴蒂雅娜·兰斯特共同挑战魔导师的升格试验。于远处凝视著两人考试的，分别是认定两人将成为“机动六课”的明日之星而投以注意的疾风与菲特、还有奈叶。在三人的注视之中，随着宣告试验开始的ReinForce II（统御之力zwei）的声音，拉开了“StrikerS”故事的序幕。。一名黑衣人突然摘下头套，是个青年男子，看上去是领队之类的人物，他道：“你又是谁，怎么会在市区出现，恐怕是梁天的同党吧，把他们一起带回去！”……