1927年，白色恐怖笼罩中国。　　中共地下党夏风和朱雷在咖啡厅秘密接头时，遭到国民党特工高扬伏击。朱雷十二岁的女儿朱美云，亲眼看见父亲死在自己面前。夏风重伤被俘，他的未婚妻、进步学生陆玫，强忍悲痛，带着朱美云匆匆逃离。　　十年后，上海沦为孤岛。已是中共炸弹专家的陆玫与组织失去联系，流落上海。成长为狙击手的朱美云一心为父报仇也返回了上海。两人与仇人高扬不期而遇。民族大义下，他们求同存异。爱国护士孟香兰，青帮阔少赵非以及保镖叶三，女游击队员铁妞等先后加入，一支独特的敌后抗日小队就此成立。　　梅机关副机关长渡边，秘密酝酿南北汉奸合流的阴谋。于此同时，军统与76号之间也正进行着一场残酷的较量。这是一场同学、朋友之间的杀戮。本着共同抗日的原则。陆玫带领小队协助高扬，惩治一批罪大恶极汉奸。同时，自己也付出了惨痛代价。军统上海站被端，中共联络员老马牺牲。最后，陆玫用计，诱使渡边上当，除掉了汉奸王貌霖。渡边南北合流的计划被迫流产。　　陆玫费劲周折，终于与组织上取得了联系。结合小队的自身特点，组织上决定由陆玫领导小队继续在敌后执行抗日任务。　　渡边获悉，国民政府正秘密向南转移一批故宫国宝。他对这批国宝虎视眈眈，立刻派76号主任王群追查线索。因军统上海站严重破坏，高扬迫不得已向陆玫求助。得到上级指示后，陆玫率领小队全力协助高扬。他们在当地游击队的配合下，成功阻击了渡边。抢在他之前将线索传递了出去。渡边的计划再次失败。　　日本随军记者武藏，因亲眼目睹了南京大屠杀的惨状，精神受到极大刺激。他携带记录有日军暴行的照片悄悄逃走。日军为毁灭证据，派出精锐特遣队一路追杀。陆玫奉命摔小队护送武藏向重庆转移。护送途中，小队误入日军秘密基地。他们亲眼目睹被军国主义洗脑的少年，亲手杀死自己的养父母。队员们受到极大震撼。武藏也开始重新审视这场战争。几番较量后。日军特遣队被消灭。南京大屠杀资料被安全送到重庆，日军暴行被公布于众。　　在地下党的协助下，陆玫率领小队为新四军战地医院购得一批紧缺药品。渡边派出间谍梅子协助佐田，妄图追踪小队，顺藤摸瓜，挖出我战地医院。陆玫识破渡边的阴谋后将计就计，故意放出假情报，诱使佐田进入事先设好的包围圈。佐田侥幸逃脱，间谍梅子却被朱美云一枪击毙。药品被顺利送到医院，伤员们得到了救治。　　渡边通过线索，发现了新四军刚刚建成的兵工厂，军工专家孙教授被佐田狙杀。为挽救我党刚刚诞生的军事工业，陆玫接到组织上下达的命令，带领小队返回上海，迎接从德国学成归来的枪械专家。渡边获悉情况，派佐田对枪械专家展开追杀。陆玫制定计划，安排高扬制造混乱，趁乱将枪械师接走。佐田一路尾随，却被朱美云巧妙狙杀。枪械师被安全送往根据地，兵工厂重新运转起来。　　痛失左膀右臂的渡边将小野、秋子调到身边。　　渡边截获了一只重要的密码箱。为完整无损的得到里边的文件，他派小野潜入提篮桥监狱，协助被关押的密码专家史密斯越狱。高扬随即也潜入监狱，试图阻止小野。却不想史密斯竟独自越狱。我党获悉这一情报后，派陆玫率领小队协助高扬夺回密码箱内的文件。在陆玫的巧妙安排下，小队将密码箱和史密斯掉包。密码箱被成功打开，高扬将文件安全送到了重庆。小队也圆满完成了任务。　　一笔爱国华侨的援助捐款存在瑞士银行，但只有租界外董弗兰克才能取出这笔钱。为此，高扬率领军统行动队奔袭苏州集中营。高扬虽然将弗兰克救出，但行动队却几乎全军覆没。陆玫接到组织命令，全力协助军统方面转移弗兰克。此次行动由军统代号为“师父”的指挥官负责。但在“师父”的计划中，这支共产党小队扮演着炮灰的角色。高扬获悉后，毅然回到陆玫等人身边，他要与曾经并肩作战过的小队成员同生共死。小队遭遇日军埋伏，朱美云牺牲。赵非和叶三用自己的生命作诱饵，将渡边引开。在掩护撤离过程中，铁妞也壮烈牺牲。最终，弗兰克虽然被安全送走，但小队却付出了惨重的代价。　　日本战败投降。试图蒙混过关逃避审判的渡边被陆玫识破，两人决斗。危机时刻，失踪多年的夏风突然出现，将渡边击毙。恋人重逢，陆玫却发现夏风身上有诸多的疑点。　　于是，陆玫暗自调查。当年的一幕渐渐清晰：朱雷得知夏风是隐藏在我党内部的卧底，于是决定锄奸。同时，夏风也感觉到自己暴露，遂命令高扬在咖啡馆埋伏。　　陆玫和夏风这对情人为了信仰反目。危机关头，高扬出现，与陆玫联手将“师父”夏风除掉。回首往事，高扬发现自己的信仰已经发生了改变，在陆玫的影响下，他从此走上了革命的道路。。“同样的理由，那地点最好是设在人迹罕至的所在，至少也要是极为荒凉的所在；但这还不够，因为再怎么荒凉，也挡不住高手的足迹。所以，我会选择一个相对很特殊的地方。在面对大陆城市的这个地方，必须是……一座入云……