在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！。宋军解下自己腰间的武器抬手一扔：“接住！”楚翔随手在空中一抓，那根不足二十分公的短棍就握在手中，而T4却不知晓，它一撞下将楚翔锋利的武器打开，接着再次跃起用从独眼中生出的丑陋大嘴啃咬楚翔，楚翔手中的短……